為了這個問題，從研究所開始到現在，我試過很多方法，但都都有一些缺點。
一開始當然是用很傳統的目錄分類法，後來因為論文要有參考文獻，就採用 bibtex 來紀錄，並且加上自己的讀後心得。為了避免找不到，我檔名還都和索引一樣，這樣在論文引用文獻才不會亂掉。缺點是要費不少心思來維護 bib 檔。而且要轉成其他軟體可以用的格式還是要多一道手續。由於是單純的文字檔，所以找東西或修改其實蠻麻煩的。
後來工作了，那文件就更多了，從 datasheet 到 application note。每一篇都有那麼一點點關係，可是又不那麼密切，更不用說還要對看過的文章或 datasheet 做筆記了。用目錄去分總覺得差一點，做筆記又怕原始文件不小心搬到不同的地方。一大堆資料不能便成隨手可得的資訊，實在很鬱悶。
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